Il nucleo originario di ciò che sarebbe divenuta l'Associazione Panificatori è già presente in Bologna sin dal 1800; già allora un gruppo di titolari di aziende si incontrava all'Osteria "dl'Uvarol" in via Gombruti per trattare di problemi di categoria quali la tassa sul macinato e il conseguente prezzo del pane. In seguito il gruppo cominciò ad assumere una propria conformazione organizzativa di tipo sindacale e, con l'avvento del fascismo, fu inglobato come Sindacato nell'Unione Commercianti all'interno della quale, comunque, manteneva una individualità ben definita. Nel dopoguerra i panificatori, che già disponevano di un loro Ente economico - la SAPAC Società Anonima Panificatori Acquisti - imposto dal fascismo nel 1939 in vista di possibili conflitti, cercarono di utilizzare al meglio detto ente per sviluppare sul piano collettivo gli acquisti di materie prime e avvertirono la necessità di darsi, anche sul piano sindacale, una struttura del tutto autonoma. Fu così costituita l'Associazione Panificatori ed oggi, nella nuovissima sede di via Cesare Gnudi 5, a Bologna, raggruppa la quasi totalità dei panifici di Bologna e Provincia. L'Associazione, seguendo la sua natura di ente sindacale, interpreta e si fa portatrice degli interessi generali della categoria. E' aderente, in sede locale, all'Ascom di Bologna e, in sede nazionale, alla Federazione Nazionale Panificatori ed al Consorzio Tutela Pane (CTP).
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L'Associazione Panificatori di Bologna ha ricevuto nell'anno 2024 i seguenti contributi pubblici:
Bando Regione Emilia Romagna 2023 "Sostegno di progetti promozionali e di valorizzazione del pane e dei prodotti da forno" CUP E48C23000280009 per Euro 60.179
