Η κύρια δραστηριότητα του Συστήματος είναι τα έργα των μπλε κάδων. Το δίκτυο των μπλε κάδων απευθύνεται στο γενικό κοινό και αναπτύσσεται σε συνεργασία με τους Δήμους στους οποίους η ΕΕΑΑ διαθέτει τους κάδους και τα ειδικά οχήματα προκειμένου να αναλάβουν τη συλλογή.
Παράλληλα, η ΕΕΑΑ αναπτύσσει και ειδικές δράσεις που στοχεύουν στη συλλογή και ανακύκλωση αποβλήτων συσκευασίας, κυρίως γυάλινων
φιαλών, από μεγάλους παραγωγούς και περιοχές επαγγελματικών δραστηριοτήτων όπου καταναλώνονται προϊόντα σε γυάλινη συσκευασία
το σύστημα δραστηριοποιείται και στον τομέα της Ανακύκλωσης των Βιομηχανικών και Εμπορικών Αποβλήτων Συσκευασίας (ΒΕΑΣ), εστιάζοντας στην καταγραφή και την προώθηση της ανακύκλωσης που επιτυγχάνεται στον τομέα της βιομηχανίας και του εμπορίου.
Τέλος, στο πλαίσιο του ισχύοντος νομικού πλαισίου που προβλέπει τη συμμετοχή και άλλων μεθόδων αξιοποίησης των αποβλήτων συσκευασίας στην επίτευξη των εθνικών στόχων η ΕΕΑΑ έχει εντάξει δραστηριότητες (π.χ. ενεργειακή αξιοποίηση, χρήση εναλλακτικού καυσίμου) και αναπτύσσει συνεργασίες σε αυτό το πεδίο με δημοτικούς ή άλλους φορείς.