Los objetivos de Aves Uruguay (ex GUPECA) son los siguientes:
1) Estudios Ornitológicos, científicos y técnicos, referidas a las distintas especies ya sea éstas residentes o migratorias, comprendiendo áreas tales como la taxonomía, morfología, fisiología, patología, ecología, etología, zoogeografía, migraciones, epizootiología, etc. y en general, toda actividad que conduzca al mayor conocimiento d
e las aves, su biología y conservación.-
2) Actividades de Conservación de las Aves y sus Hábitats, incluyendo la prevención de su extinción y la realización de trabajos tendientes a su preservación y calidad de vida en su medio natural, protegiendo los sitios y hábitats de los que dependen. Reconocimiento de áreas de importancia para la conservación de las aves (AICAs, Áreas de Importancia Para la Conservación de las Aves o IBAS, por su sigla en inglés) ya sean éstas residentes o migratorias.-
3) Identificación de poblaciones y rutas de aves migratorias.-
4) Educación y divulgación de temas ornitológicos y, en particular, referidos a la sobre conservación de las aves y sus ambientes naturales. Realización de ateneos para la presentación y discusión de trabajos de investigación, realización de conferencias y difusión del conocimiento de las aves por todos los medios (sin que ello signifique una enumeración taxativa, tales como prensa, radio, televisión y páginas web). Edición de publicaciones científicas y de divulgación. Preparación de material didáctico, boletines, guías para el reconocimiento de aves. Organización de cursos. Formación en técnicas de anillamiento. Talleres ornitológicos. Expediciones de campo para la observación y realización de inventarios de aves.-
5) Promover la defensa de la biodiversidad y el bienestar humano, destacando en particular el papel de las aves. Difundir la información sobre la alimentación de las aves y sus hábitats. Difundir el conocimiento de las aves como indicadores de la conservación de la vida silvestre en general y del cambio ambiental. Colaborar en estudios de impacto ambiental de obras de infraestructura e implantación de nuevas industrias. Asesorar en el dictado e implementación de normas para la protección de las aves silvestres. Procurar la consideración de la protección de las aves silvestres en la certificación ambiental de productos y procesos. Estimular actividades económicas que integren entre sus objetivos la conservación de las aves.-
6) Constituirse en unidad ejecutora de proyectos, contribuir y organizar proyectos, centros de actividad, unidades ejecutoras, entidades de servicios y organizaciones afines, cualquiera sea su denominación, constituyéndose en entidad organizadora o partícipe conjuntamente con organizaciones nacionales o internacionales, en actividades vinculadas al objeto de la asociación.-