【聯盟第一屆】
第一屆北學聯於2012年3月「臺灣北部大專院校學生會聯盟籌備委員會」取得各校共識及簽署文件後正式成立，召集人為政治大學歷史學系雙主修政治學系學生－林家興擔任。
【聯盟第二屆】
經團隊內部選舉及協調，北學聯於2013年8月交棒予第二屆團隊，召集人為臺灣科技大學企業管理系雙主修科技管理學士學位學程學生－陳嘉緯接任，副召集人由政治大學歷史學系雙主修政治學系學生－施漢陽接任。
【聯盟第三屆暨成立社會團體籌備會】
北學聯第二屆團隊於2014年7月21日任期將屆之時，成立「臺灣北部大專院校學生會聯盟成立社會團體籌備會」，除原先第三屆團隊遴選之外，另行召集一專案團隊處理組織成立社團團體一案；而後於2014年8月，成立社會團體籌備會主任委員由政治大學政治學系學生－褚映汝接任，行政團隊暫無召集人，聯盟事務亦暫由成立社會團體籌備會代為管理。
【成立社會團體過程】
2014年末，經北學聯成立社會團體籌備會團隊議決，北學聯召集30名學生自治夥伴，成立「臺灣北部大專院校學生自治聯合協會（簡稱亦為北學聯）籌備會」。組織待內政部審核期間，活動及與各校間互動減少。
2015年5月12日，內政部准許北學聯進行社會團體成立籌備程序；2015年8月9日，召開發起人暨第一次籌備會議，由發起人陳嘉緯當選籌備會主任委員、發起人代表褚映汝當選籌備會會計、發起人呂鴻祺當選籌備會執行秘書。
2015年10月11日召開第二次籌備會議後，確定於2015年11月8日舉辦協會成立大會。
【協會第一屆】
北學聯於2015年11月8日舉行協會成立大會暨第一屆第一次會員大會，於會中決議通過協會章程、2015及2016年度工作計畫暨預算書，並選舉理事9位、候補理事3位、監事3位及候補監事1位。
後接續召開第一屆第一次理監事聯席會議，推選出理事長何世昌、副理事長褚映汝、常務理事陳佳菁、理事林家興、理事呂鴻祺、理事陳嘉緯、理事施漢陽、理事梁辰、理事莊泓毅、候補理事顏世銘、候補理事蘇裕勝、候補理事林威呈、常務監事黎家維、監事劉鎮瑋、監事陳奐宇、候補監事吳律德，並聘任秘書長黃凱琳，任期自2015年11月8日起至2017年11月7日止。
2016年8月20日因理事長何世昌個人規劃，請辭理事長及常務理事一職，經第一屆第六次理事會議暨第三次監事會議決議請辭案，並於該次會議補選理事林家興遞補常務理事及理事長兩職，任期自2016年8月20日起至2017年11月7日止。
2017年3月13日向臺灣新北地方法院聲請法人設立登記，於同月15日完成程序並取得社團法人資格。
【協會第二屆】
北學聯於2017年11月5日舉行第二屆第一次會員大會，於會中決議修正協會章程第15條（理事席次自9席調整為11席）、2018年度工作計畫暨預算書，並選舉理事11位、候補理事3位、監事3位及候補監事1位。
後接續召開第二屆第一次理監事聯席會議，推選出理事長褚映汝、副理事長陳嘉緯、常務理事李昀城、理事陳奐宇、理事陳佳菁、理事梁辰、理事蔡曜謙、理事高崇皓、理事黃子誠、理事陳佑宗、常務監事劉鎮瑋、監事黎家維、監事何世昌，任期自2017年11月8日起。
【協會第三屆】
北學聯於2021年8月15日舉行第三屆第一次會員大會，於會中決議修正協會章程第15條（理事席次自11席調整為9席、增加理監事單一性別相關規定）、第26條（會員大會召開規定）、第29條（理監事會議召開規定）、2021年度工作計畫暨預算書，並選舉理事9位、候補理事3位、監事3位及候補監事1位。
後接續召開第三屆第一次理監事聯席會議，推選出理事長黃子誠、副理事長馮輝倫（代表國立臺灣師範大學學生會）、常務理事宋俊賢、理事施蕙心、理事陳奐宇、理事陳冠穎、理事張芹芸、理事詹凱淇、理事蔡曜謙、常務監事林昱志、監事林家興、監事謝佩玲，並聘任李昀城擔任本會秘書長一職，任期自2021年8月15日起。
