隨著現今質譜技術的蓬勃發展，為使台灣質譜學者間能有充分技術交流機會，以提升質譜技術研發能量，廣而宣達於不同領域上之應用，以協助解決各研究領域所面臨之問題，故特地成立「台灣質譜學會」。
台灣大學何國榮教授受推舉為籌備召集人，於國內相關領域多位教授奔波協助下，終於在2003年7月順利成立，由何國榮教擔任第一屆理事長。
台灣質譜學會目前會員人數約為750人，除了每年定期舉行年會、研討會外，更於每年分別在北、中、南開辦質譜訓練課程，推廣質譜應用技術。台灣質譜學會為提升台灣質譜技術，並協助國內研究人員與國際技術接軌，期許能將交流領域擴大至大陸及海外華人，因此於2005年曾邀請大陸學者來台參與2005年華人質譜學會交流研討會，2006年亦組團至新疆參加「第一屆華人質譜技術交流研討會」，2008年在台灣舉行「第二屆世界華人質譜研討會」；除了本地學者外，更有來自美國、加拿大、香港、新加坡以及大陸等華人
學者共襄盛舉，進行專題演講。
2009年，由中山大學謝建台教授當選第三屆台灣質譜學會會長，秉著精益求精的精神，不但大力支持於國內舉辦各種專題研討會及訓練課程，更於2009年組團至日本筑波參與「第一屆亞太質譜年會」及2010年至中國長春參與「第三屆世界華人質譜會議」，除此之外，台灣質譜學會增設青年學者研究獎，藉此鼓勵國內優秀質譜研究人員，亦完成架設台灣質譜學會中英文網站，促進國內學者及與世界各國質譜學研究人員之交流。由此可見質譜技術的重要性和廣泛性。
本學會期許能藉此將大家群聚在一起，不但可以促進情感上之交流，亦可進行技術之交流，提升研究能力，促進華人在各領域的發展，希望未來能更持續性發展，甚而擴大，讓更多人有參與及了解的機會，使質譜之能力，遠播世界。
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