บาทหลวงมารีอุส หลุยส์ เบรย์ เป็นผู้ก่อตั้งโรงเรียนมารีย์วิทยา โดยได้รับใบอนุญาตจากกระทรวงศึกษาธิการ วันที่ 7 เมษายน พ.ศ. 2499 เปิดทำการเรียนการสอนเมื่อวันที่ 16 พฤษภาคม พ.ศ. 2499 โดยให้ภคินีคณะเซนต์ปอล เดอ ชาร์ตร ดำเนินการบริหารงาน เปิดสอนระดับประถมศึกษา มีนักเรียน จำนวน 210 คน ครู 6 คน เซอร์จำนวน 3 คน โดยเซอร์โยโซฟอันนา ดำรงตำแหน่งอธิการิณี เซอร์อัลฟองส์ เดอ แซงปีแอร์ ดำรงตำแหน่งผู้จัดการแ
ละครูใหญ่
ปีการศึกษา 2506 เปิดทำการเรียนการสอนระดับมัธยมศึกษาตอนต้น มีนักเรียนจำนวน 1,300 คน ครู 45 คน โดยเซอร์ทองเทพ อุดมเดช ดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ และในปีเดียวกันนี้ โรงเรียนได้รับการรับรองวิทยฐานะ ให้เทียบเท่าโรงเรียนรัฐบาลของกระทรวงศึกษาธิการ
ปีการศึกษา 2509 เปิดทำการเรียนการสอนตั้งแต่ระดับอนุบาลศึกษา ระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย
เนื้อที่โรงเรียนทั้งสิ้น 27 ไร่ มีอาคารเรียน 5 หลัง อาคารประกอบ 7 หลัง อาสนวิหาร 1 แห่ง บ้านพักพระสงฆ์ 1 หลัง บ้านพักคณะซิสเตอร์ 1 หลัง อาคารหอพัก 5 แห่ง สนามกีฬา 2 แห่ง และสระว่ายน้ำ 2 แห่ง
ปีการศึกษา 2532 โรงเรียนมารีย์วิทยาได้รับรางวัลพระราชทานระดับมัธยมศึกษาขนาดกลาง
ปีการศึกษา 2542 โรงเรียนมารีย์วิทยาได้รับรางวัลพระราชทานระดับก่อนประถมศึกษาขนาดใหญ่ ปีการศึกษา 2547 โรงเรียนได้ผ่านการประเมินคุณภาพภายนอก ในระดับก่อนประถมศึกษา ประถมศึกษา และมัธยมศึกษา จากสำนักงานรับรองมาตรฐานและการประเมินคุณภาพการศึกษา
(องค์การมหาชน)
ปีการศึกษา 2548 เซอร์สกอลัสติก สัณฐิติ ขออนุญาตเปลี่ยนแปลงความจุนักเรียนจาก 5,000 คน เป็น 6,875 คน และได้ขยายห้องเรียนคอมพิวเตอร์เพิ่มขึ้นจากเดิมอีก 3 ห้อง ห้องละ 60 เครื่อง เพื่อให้เพียงพอต่อความต้องการใช้ อีกทั้งยังได้ขยายห้องปฏิบัติการทางวิทยาศาสตร์ ระดับมัธยมศึกษาเพิ่มขึ้น 2 ห้อง โดยแบ่งเป็นห้องปฏิบัติการทางชีววิทยา 1 ห้อง และห้องปฏิบัติการทางฟิสิกส์อีก 1 ห้อง นอกจากนั้นยังได้ดำเนินการเปิดห้องอิเล็กโทนขึ้น เพื่อเป็นการส่งเสริมและพัฒนาทักษะทางด้านดนตรีให้กับนักเรียน และในปีนี้ ทางสมาคมศิษย์มารีย์วิทยาได้ร่วมกับโรงเรียนสร้างอนุสรณ์สถานเพื่อรำลึกถึงบาทหลวงมารีอุส หลุยส์ เบรย์ ผู้ก่อตั้งโรงเรียน ที่บริเวณหน้าอาคารมารีอุส และยังได้มีการตั้งชมรม To Be Number One ขึ้นเพื่อรณรงค์ให้นักเรียนห่างไกลจากยาเสพติด
ในปีการศึกษา 2549 ทางโรงเรียนได้จัดโครงการจัดการเรียนการสอนตามหลักสูตรกระทรวงศึกษาธิการเป็นภาษาอังกฤษ (English Program) โดยเริ่มจากชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 และยังได้เริ่มโครงการ Intensive English Course สำหรับนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 มัธยมศึกษาปีที่ 1 และ 2 ด้วย
นอกจากนี้โรงเรียนยังได้รับเกียรติบัตรต่างๆ มากมาย ซึ่งแสดงให้เห็นถึงความดีเด่นหลายด้าน ทั้งของ ผู้เรียน ครู และผู้บริหาร นับเป็นสิ่งที่นำมาซึ่งความภาคภูมิใจเป็นอย่างยิ่งและเป็นกำลังใจให้กับทุกฝ่ายในการดำเนินงานอย่างเต็มที่เพื่อส่งเสริมให้ผู้เรียนทุกคนเป็นคนดี และคนเก่งของสังคม ซึ่งส่งผลให้โรงเรียนได้รับความศรัทธาและยอมรับจากผู้ปกครอง ชุมชนท้องถิ่น และคาดหวังไว้ว่าในอนาคตโรงเรียนมารีย์วิทยา จะต้องพัฒนาให้มีคุณภาพและประสิทธิภาพยิ่งๆขึ้น อันจะนำมาซึ่งความมีมาตราฐานทางการศึกษาให้เป็นที่ยอมรับในระดับสากลต่อไป
ในปีการศึกษา 2549 มีนักเรียนตั้งแต่ระดับอนุบาลศึกษาถึงมัธยมศึกษาปีที่ 6 จำนวน 6,085 คน มีครูทั้งสิ้นจำนวน 249 คน มีพนักงาน / คนงานทั้งสิ้นจำนวน 130 คน (สำรวจเมื่อวันที่ 10 มิถุนายน 2549 ) โดยมีบาทหลวงสุรินทร์ ประสมผล ดำรงตำแหน่งผู้รับใบอนุญาตและผู้จัดการ และซิสเตอร์ดร.วิภาดา สัณฐิติ ดำรงตำแหน่งอธิการิณี และผู้อำนวยการ
ในปีการศึกษา 2553 โรงเรียนเปิดทำการเรียนการสอน 3 หลักสูตร คือ หลักสูตรปฐมวัย หลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน และหลักสูตร English Program มีนักเรียนจำนวน 6,184 คน มีครูและบุคลากรทางการศึกษา จำนวน 295 คน มีห้องเรียน 157 ห้อง (ข้อมูล ณ วันที่ 10 มิถุนายน 2553) โดยมี บาทหลวงสมชัย พงศ์ศิริพัฒน์ เป็นผู้จัดการ/ผู้ลงนามแทนผู้รับใบอนุญาต มีซิสเตอร์ ดร.วิภาดา สัณฐิติ เป็นอธิการิณี และผู้อำนวยการโรงเรียนมารีย์วิทยา
ปัจจุบันปีการศึกษา 2555 มีบาทหลวงสมชัย พงศ์ศิริพัฒน์ เป็นผู้จัดการ/ผู้ลงนามแทนผู้รับใบอนุญาตและมีซิสเตอร์สายอรุณ ผิวเกลี้ยง เป็นอธิการิณีและผู้อำนวยการโรงเรียนมารีย์วิทยา โรงเรียนเปิดทำการเรียนการสอนใน 3 หลักสูตร คือ หลักสูตรปฐมวัย หลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน และหลักสูตร English Program มีนักเรียนจำนวน 6,221 คน มีครูและบุคลากรทางการศึกษาจำนวน 285 คน มีห้องเรียน 157 ห้อง (ข้อมูล ณ วันที่ 31 พฤษภาคม 2555)
