โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคม เป็นโรงเรียนมัธยมขนาดกลาง ประจำอำเภอ ได้เปิดทำการสอนตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ ขึ้นเมื่อวันที่ 30 มีนาคม 2521โดยเปิดสอนตามหลักสูตรกระทรวงศึกษาธิการ 2 หลักสูตร คือ หลักสูตรมัธยมศึกษาตอนต้นสายสามัญ พ.ศ.2503 (ม.ศ.) โดยรับผู้จบชั้นประถมศึกษาปีที่ 7 และหลักสูตรมัธยมศึกษาตอนต้น พ.ศ.2521 โดยรับผู้จบชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 เป็นการรับนักเรียนม.1 และ ม.ศ.1 พร้อมกัน
ก่อ
นการประกาศตั้งโรงเรียน 1 ปี เข้าร่วมประกาศยกฐานะท้องที่ตำบลห้วยทับทัน ตำบลกล้วยกว้าง ตำบลเมืองหลวง ตำบลผักไหม อำเภออุทุมพรพิสัย ขึ้นเป็นกิ่งอำเภอชื่อว่า "กิ่งอำเภอห้วยทับทัน" โดยมีนาย กาญจ์ ลอยมา ดำรงตำแหน่งปลัดอำเภอผู้เป็นหัวหน้ากิ่งอำเภอ กำนัน ผู้ใหญ่บ้าน พ่อค้า ประชาชน ข้าราชการ โดยการนำของนายกลม จึงตระกูล กำนันตำบลห้วยทับทัน ซึ่งขณะนั้นเป็นสมาชิกสภาจังหวัดด้วย ได้ร่วมกันจัดงานหาเงินเพื่อสร้างอาคารเรียนชั่วคราวได้เงินงบประมาณ 11,000 บาท ประมาณเดือนมีนาคม 2521 จึงได้เริ่มก่อสร้างอาคารเรียนชั่วคราวแบบมุงหลังคาเสาไม้ทุบเปลือก ขนาด 6.30 เมตร
วันที่ 27 เมษายน 2521 กรมสามัญศึกษา(เดิม) ส่งนายประพาส ไชยสาร จากโรงเรียนกำแพง อำเภออุทุมพรพิสัย ซึ่งขณะนั้นดำรงตำแหน่งผู้ช่วยอาจารย์ใหญ่ มาดำรงตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ สถานที่ตั้งโรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคม อยู่ในเขตบ้านห้วยทับทัน อำเภอห้วยทับทัน จังหวัดศรีสะเกษ ในเนื้อที่ประมาณ 77 ไร่ 3 งาน 54 ตารางวา
ปี พ.ศ. 2531 โรงเรียนเข้าร่วมโครงการขยายโอกาสทางการศึกษา (ค.อมต.สศ.)
ปี พ.ศ. 2534 เปิดโรงเรียนสาขาที่ตำบลผักไหม อำเภอหัวยทับทัน จังหวัดศรีสะเกษ
ปี พ.ศ. 2535 โรงเรียนได้รับอนุมัติให้เปิดเรียนระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลายและเข้าร่วมโครงการการศึกษาเพื่อชีวิตและสังคม
ปี พ.ศ. 2536 โรงเรียนเข้าร่วมโครงการการมัธยมศึกษาเพื่อพัฒนาชนบท (มพช.2 รุ่น 1)
ปี พ.ศ. 2549 โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคมได้ผ่านการประเมินเป็นโรงเรียนต้นแบบ หนึ่งอำเภอหนึ่งโรงเรียนในฝัน
ปี พ.ศ. 2561 โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคมได้ผ่านการประเมินเแบบยั่งยืนระดับเพชร โรงเรียนศีล 5 ตามรอยพ่ออย่างพอเพียง
ปี พ.ศ. 2561 โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคมได้ผ่านการประเมินเป็นโรงเรียนมาตรฐานสากล ScQA
ปี พ.ศ. 2562 โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคมได้ผ่านการประเมินเป็นโรงเรียนคุณภาพประจำตำบล ระดับมัธยมศึกษา หนึ่งตำบลหนึ่งโรงเรียนคุณภาพ
ปี พ.ศ. 2564 โรงเรียนห้วยทับทันวิทยาคมได้ผ่านการประเมินเป็นสถานศึกษารางวัลพระราชทาน ระดับมัธยมศึกษา ขนาดกลาง
คติธรรมประจำโรงเรียน "สุโข ปัญญา ปฏิลาโภ"
คำขวัญประจำโรงเรียน "รักษ์ศักดิ์ศรี มีวินัย ใฝ่ศึกษา มารยาทงาม"
สีประจำโรงเรียน "ชมพู - ม่วง"
สีชมพู หมายถึง ความรัก ความปรารถนาดี ที่มีต่อกันและพร้อมที่จะประสาน ผนึกกำลังความสามารถ สร้างความเป็นอันหนึ่งอันเดียวกัน เพื่อก้าวสู่สิ่งที่ดีงาม
สีม่วง หมายถึง ความสุขุมเยือกเย็น และอ่อนโยน เปรียบประดุจจิตใจของเราที่มีความสุภาพอ่อนโยน เอื้อเฟื้อเผื่อแผ่ โอบอ้อมอารี มองโลกในแง่ดี เป็นมิตรกับทุกคน
ต้นไม้ประจำโรงเรียน คือ "ต้นพิกุล" หมายถึง ความมั่นคงอย่างมีคุณภาพของสถาบันและการผดุงรักษาเอกลักษณ์ที่ดีงามของไทย