FLACSO es una organización regional y autónoma, dedicada a la enseñanza e investigación. La unidad FLACSO El Salvador inició en 1992, como proyecto temporal. Su ámbito de actividad es en lo fundamental El Salvador, y su actividad centroamericana procura la coordinación con las unidades de FLACSO en Costa Rica y Guatemala. Hasta 1995 concentró su actividad en proyección, difusión, capacitación y docencia no formal, pero en 1996 inició un proceso de fortalecimiento de la investigación. Actualmente, FLACSO El Salvador posee una agenda de investigación que privilegia proyectos vinculados a la formulación y/o ejecución de políticas públicas. El programa de investigación de FLACSO El Salvador se estructura en torno a cuatro áreas que desde la visión institucional constituyen ejes fundamentales para la agenda de desarrollo político y social del país y en las cuales vuelca sus esfuerzos, siendo las siguientes:
Área 1: Juventud y Desarrollo Humano
Área 2: Educación y Mercados de Trabajo
Área 3: Gobernabilidad, Democracia y Seguridad Ciudadana
Área 4: Dinámicas Global-locales: Problemas de Desarrollo Económico y Social en El Salvador
La visión de FLACSO El Salvador es ser una institución de referencia en ciencias sociales reconocida por la calidad de su trabajo en investigación y formación, y por su capacidad propositiva, en áreas relevantes de la política social de la región centroamericana, financieramente sostenible y organizativamente operativa.
