Pero tuvo un proceso de gestación previo que se remonta hasta el año 1954, cuando una profesora norteamericana, Ruth Siemens, llegó a Lima para enseñar en un colegio particular. Ella, en su país de origen, había participado del Movimiento hoy conocido como InterVarsity Christian Fellowship y tuvo interés de reunir a algunos estudiantes universitarios para estudiar la Palabra de Dios utilizando el
método inductivo. De esta manera se dio origen al grupo germinal de este ministerio, bajo el liderazgo de Samuel Escobar Aguirre. Esta obra fue creciendo entre los universitarios y varios jóvenes conocieron al Señor a través del testimonio de la Comunidad Bíblica Universitaria (CBU). El año 1963 se convocó a un primer Congreso Nacional, donde nació este movimiento misionero como un trabajo de cobertura nacional. AGEUP nació para extender el Reino de Dios en las universidades y demás centros de educación superior del Perú y tener una presencia cristiana significativa en la vida de nuestro país. Ya han pasado 40 años y podemos ver que Dios nos ha acompañado a través del tiempo: Anunciando el evangelio en las universidades, discipulando y formando líderes para la iglesia, docentes e investigadores íntegros para la universidad, profesionales cristianos para nuestro país; compartiendo una palabra profética en los diferentes contextos que el Perú ha vivido. Actualmente existe un fuerte énfasis en las relaciones humanas como base para presentar creativamente el evangelio y la propuesta del Reino de Dios, juntamente con trabajos vivenciales de servicio. Los grupos han aumentado en número y la posta pasa rápidamente a nuevos líderes. La agenda prioritaria para esta nueva generación pasa por la afirmación de su identidad misionera, el conocimiento de su historia, la afirmación de su visión de trabajo, el compromiso con la transformación integral de los estudiantes de educación superior y de sus centros de estudio, y el compromiso con la realidad social y nacional de nuestro país.
