En el año 1998 el Perú sufrió los embates del Fenómeno “El Niño”. El departamento de Ica no fue considerado como zona de emergencia. El 28 de enero de ese mismo año se produjo el desborde del río Ica, ocasionando grandes pérdidas materiales y económicas. No hubo una respuesta organizada por parte de la Universidad aunque si existió una respuesta aislada por parte de algunos grupos de alumnos de la
Facultad de Medicina. El 11 de noviembre de 1999, se realizó el simulacro nacional “El once a las once”, organizado por el Sistema Nacional de Defensa Civil. Por primera vez, tanto docentes, trabajadores y alumnos de la Facultad de Medicina UNSLG se organizan para afrontar posibles eventos adversos. Los alumnos viendo la necesidad de tener una organización capaz de afrontar los eventos adversos que pudieran ocurrir en la ciudad dan nacimiento al Comité Operativo de Emergencia. El COE-FMH, fue creado mediante Resolución Decanal Nº 006-D-FMHDAC-00 del 13 de Enero del 2000, con el apoyo de las autoridades de la facultad
