Analfe cuenta con oficinas y sede propia en Bogotá, ubicada en el sector de Teusaquillo. Tiene cobertura nacional, a través de sus cinco regionales, con oficinas que prestan servicios a los Fondos de Empleados de cada zona así:
- Regional Caribe, en Barranquilla
- Regional Occidente, en Cali
- Regional Eje Cafetero, en Manizales
- Regional Antioquia, en Medellín
- Regional Centro, Bogotá y Bucara
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Actualmente operan cinco unidades estratégicas que apoyan a los Fondos de Empleados para hacerlos más eficientes, formando y capacitando a asociados y directivos, ofreciendo asesoría en la operación financiera y apoyo en las demás áreas de la organización solidaria. Las unidades estratégicas son:
- Representación y Asistencia Técnica
- Escuela Virtual Analfe, E.V.A.
- Serfiscal
- Financiafondos
- Afianzafondos