Dés le début et jusqu'en 2004 c'est l'association Zebra Crossing qui a défendu avec conviction l'esprit originel de cette fête, et qui, au fil des ans, l'a amenée à devenir une manifestation importante et réputée loin aux alentours. Malheureusement après toutes ces années, les forces vives de cette association se sont vues quelques peu épuisées. La 10ème édition, plus légère et mise sur pied en se
ulement 3 mois, vit tout de même le jour en 2005 grâce au regroupement de quelques personnes pour qui l'idée de voir disparaitre cette manifestation n'était simplement pas envisageable. C'est ainsi que l'association Arts, Fêtes et Musiques (AFM) vit le jour. Le noyau de personnes s'agrandit et l'édition 2007 a marqué le retour en force de la Fête de la Musique de La Chaux-de-Fonds, avec une programmation sur 12 sites, comprenant 35 formations, un public en force (6'000 personnes le 21 juin) et des soutiens et partenariats conséquents! Cependant tout comme son prédécesseur, après également 9 (!) années à organiser la manifestation, l'énergie s'en est gentiment allée. C'est ainsi que dans une volonté commune de ne pas voir une année sans Fête de la Musique, l'édition 2014 voit le jour co-organisée par le Conservatoire de musique neuchâtelois (CMNE), l’Association Cantonale des Musiques Neuchâteloises (ACMN) et le Service des Affaires Culturelles de la Ville de La Chaux-de-Fonds. Alors que cette 19ème édition est mise sur pied par ces trois partenaires, l’Association Fête de la Musique La Chaux-de-Fonds nait à son tour et aide à l’organisation. Depuis l'été 2014, cette association a prit les commandes de la manifestation.
