本會創立於民國四十二年六月一日，當時名稱為「高雄市儀器化工原料商業同業公會」。經過五屆至民國五十二年五月依照商業團體改進方案，於同年八月三十一日召開第六屆第一次會員大會，與化工業分開獨立為儀器商業同業公會。也因此自此屆起重新改稱為第一屆，並共歷經七屆十六年，至民國六十八年高雄市昇格為院轄市，於同年十二月十二日召開之會員大會，再稱為改制後的第一屆。因此本會會歷雖至今（九十七）年已屆滿五十五年而本屆仍稱之為第十屆是為之故。
本會自創辦迄今新舊歷經二十二屆五十五年，會歷在本市人民團體組織中可算得上資深。於此漫長歲月中，蒙各屆理事長領導有方，並經各屆理監事衷心共同為公會盡力，如民國五十四年獨立後第二屆實施公會基金籌募方法，為公會基金積存制度奠下基石；改制後第二屆創辦會員子女獎學今金制度，以鼓勵會員子女努力向學；繼之第三屆亦花費心血將自民國四十二年創會以來之破舊會員會籍資料逐一重新編冊建立新
資料卡等，在在均使本會會務發展日趨完善。
第四屆更在全體理監事的熱心努力下，於八十年四月舉辦「第一屆高雄國際儀器展」，並將其盈餘再加上會員及外埠同業先進踴躍樂捐，使公會得以順利購置會館並有能力聘請專任會務人員，到八十年底因會員數已超過三百家，依章程得改採會員代表制，辦理首次會員代表選舉。
第五屆通過常年會員收取辦法，使公會有固定收入得以全力發展會務，八十一年公會全面電腦化，便利會員換證，積極與國內外友會交流，為會員提供最新資訊，每年組團赴日參觀儀器展，與日方建立深厚情誼。
第六屆更因會務健全積極為會員服務，於八十四年獲市政府評定為「優等公會」，八十六年在內外條件均不理想狀況下，毅然沿續傳統舉行了第三屆高雄國際儀器展，並蒙當時高雄市吳敦義市長蒞臨祝賀。
第七屆適逢九二一大地震，公會樂捐參拾萬元，當屆理監事樂捐貳拾萬元，合計伍拾萬元交予市政府社會局。並於八十七年再度入選市商會「績優公會」，八十九年市政府評定為「甲等團體」，五、六年間本會能於全市近千個人民團體中，二度獲主管機關肯定，實是全體會員之榮耀。
第八屆於九十年二月成立，由徐王明華女士擔任理事長，她對能擔任二十一世紀第一任理事長深感榮幸,對該屆只有一個希望「新世紀、新思維、新作為」，期待公會於二十一世紀也能有更新的風貌，九十二年適逢公會五十週年，舉辦系列週年慶活動、編印50週年特刊，並於「大高雄世貿廣場」舉辦2003高雄國際儀器展。
第九屆於九十三年二月二十日產生，由王世洪先生擔任理事長，本屆理監事添了許多新血，期盼能為公會帶來更多的衝勁、更多活力，始能對會員先進有更好的服務品質，九十五年在「國立科學工藝博物館展示廳」舉辦2006年第五屆高雄國際儀器展。
第十屆於九十六年三月九日的會員大會正式成立，選出本屆新任理監事，由曾賜堂先生擔任理事長，本屆又網羅了5位理監事新秀精英，使公會又有新氣象、新活力，除了原有的良好服務品質外，特別推動會員全面E化，如e-mail、網站，逐漸減少傳真與郵寄。九十六年七月公會網站正式開站對外公開，介紹本會沿革，歷任理事長、理監事以及全體會員資料和營業項目。對會員的公告事項也鋪上網站，也將相關單位對於會員有關的資訊、講習、國外展覽等等隨時更新公告於網站，使本會會員與公會的互動進入一個嶄新的紀元。九十八年起會費由月繳200元修改為年繳2500元。 九十八年三月十九至二十一日於國立科學工藝博物館展示廳，舉辦「09’第六屆高雄國際儀器展」；十一月榮獲高雄市商業會頒發績優公會與績優理事長、總幹事獎；九十九年一月響應科工館「大手牽小手」活動幫助弱勢中低收入戶學生免費多次參觀科工館。
第11屆於99年3月5日成立，王理事長原為本會常務監事，參與會務工作多年，社團經驗豐富，在他任內成功舉辦了「2012 KIIS第七屆高雄國際儀器展」、「2012第一屆儀器精品選拔」、「碩博士研究論文壁報比賽」；為促進同業之間的交流也舉辦多次會員旅遊、登山等聯誼活動；參加講習會議、轉達政府相關法令宣導；為鼓勵會員子女向學，鍛鍊強健體魄，連續三年於柴山頒發獎學金；為維繫各友會的團結情誼，前往祝賀、參與活動慶典等。今年初本會理監事愛心不落人後，再次響應了科工館「點亮綠博平安燈、百萬關懷弱勢情」公益扶弱的捐助活動。
第12屆於102年3月1日組成，洪理事長水添眾望所歸，當選本屆理事長，王定國先生與陳慶芳先生兩位當選常務理事；張振南先生當選常務監事。洪理事長原為本會常務監事，參與會務工作多年，社團經驗豐富，相信在其領導下，將能帶領本公會更加蓬勃發展，邁向另一個里程碑。
