Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe

Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe Biotechnologie

26/05/2026

Le 26 mars 2026, à l’Hôtel El Mouradi Gammarth à Tunis, nous avons célébré ensemble la clôture du projet NGS-4-EcoProd, une initiative porteuse d’innovation, de collaboration et d’engagement pour une production plus durable et responsable.

Cette cérémonie a été l’occasion de revenir sur les réalisations du projet, de partager les expériences des différents partenaires et de mettre en lumière les impacts positifs générés tout au long de cette aventure.

🙏 Un grand merci à tous les partenaires, experts, participants et invités qui ont contribué au succès de ce projet et à la réussite de cet événement.

📽️ Découvrez dans cette vidéo récapitulative les moments forts de cette journée riche en échanges, en inspiration et en perspectives d’avenir.

Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Consortium! 🎉We are delighted to announce the acceptance of our third scientif...
26/05/2026

Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Consortium! 🎉
We are delighted to announce the acceptance of our third scientific publication related to WP1 – Task 1.2: Extremozymes within the Horizon Europe Twinning Project NGS-4-ECOPROD (Grant Agreement No. 101079425)! 🚀🧬
📄 Accepted in the International Journal of Molecular Sciences (IJMS, Q1, IF: 4.9):
📝 Title:
Hybrid Whole-Genome Sequencing of Penicillium crustosum CTM10622 Uncovers a Highly Thermostable Alkaline Serine Lipase with Biotechnological Relevance
👩‍🔬👨‍🔬 Authors:
Sondes Mechri, Afef Najjari, Séverine Croze, Fakher Frikha, Nadia Zarai, Hadda-Imene Ouzari, Alexandre Noiriel, Ebru Toksoy Öner, Abdelkarim Abousalham, Marilize Le Roes-Hill, Slim Tounsi, Joel Lachuer*, and Bassem Jaouadi*
🌟 This article belongs to the Section: Macromolecules of IJMS.
This study demonstrates the power of hybrid whole-genome sequencing combining Illumina and Oxford Nanopore technologies for the exploration of extremophilic fungi isolated from Tunisian extreme environments. The work enabled the identification and characterization of a novel highly thermostable alkaline serine lipase with strong potential for industrial biotechnology, green biocatalysis, biodiesel production, and detergent applications.
🌍 This publication represents another important milestone for the NGS-4-ECOPROD consortium following our previous publications on:
✅ Whole-genome sequencing of Streptomyces cyaneofuscatus for protease discovery (International Journal of Biological Macromolecules, Q1, IF: 8.5)
🔗 https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2025.146696
✅ Integrated metagenomics and metataxonomics of Tunisian hypersaline ecosystems (International Journal of Molecular Sciences, Q1, IF: 4.9)
🌟 This article belongs to the Special Issue:
“25th Anniversary of IJMS: Updates and Advances in Molecular Microbiology”
🔗 https://www.mdpi.com/1422-0067/27/11/4714
Together, these studies reinforce the importance of combining genomics, metagenomics, and functional biotechnology approaches to discover novel extremozymes and ecofriendly biomolecules from extreme Tunisian ecosystems.
💡 Funding & Project Acknowledgment:
This work was conducted within the European Union’s Horizon Europe Research and Innovation Program under the HORIZON-Coordination and Support Action (CSA), HORIZON-WIDERA-2021-ACCESS-03-01, through the Twinning Project NGS-4-ECOPROD entitled:
“FROM NEXT GENERATION SEQUENCING MICROORGANISMS TOWARDS ECOFRIENDLY BIOTECH BASED PRODUCTS”.
🤝 The project is coordinated by Prof. Slim Tounsi at the Centre of Biotechnology of Sfax (CBS, Tunisia), in collaboration with Université Claude Bernard Lyon 1 (France) and Georg-August-Universität Göttingen (Germany).
🙏 We sincerely thank all collaborators, students, researchers, reviewers, and partner institutions for their valuable contributions, scientific support, and excellent teamwork throughout this achievement.
🚀 We remain committed to advancing sustainable biotechnology, extremozymes research, and cutting-edge omics sciences through international collaboration and innovation.
Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe
Centre de Biotechnologie de Sfax -مركز البيوتكنولوجيا بصفاقس - -

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.4 est consacrée à l’étude et à l’optimisation d...
26/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.4 est consacrée à l’étude et à l’optimisation de la biosynthèse de l’ergothionéine, un puissant antioxydant naturel, à partir de souches fongiques indigènes. 🍄🧬
Cette task repose sur des approches génomiques innovantes utilisant les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Les travaux portent notamment sur :
✅ L’identification de souches fongiques surproductrices d’ergothionéine
✅ Le séquençage génomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’assemblage et l’annotation avancée des génomes fongiques
✅ L’identification des voies de biosynthèse de l’ergothionéine
✅ Le clonage et l’expression des gènes d’intérêt dans Saccharomyces cerevisiae
✅ L’optimisation des conditions de culture et des procédés de production et de purification de l’ergothionéine

Cette task vise à développer des stratégies biotechnologiques innovantes pour une production durable et efficace de molécules naturelles à haute valeur ajoutée pour les secteurs de la santé, de la nutrition et de la bioéconomie verte. 🌱

👩‍🔬 Task Leads : CBS Dr Najla Kharrat
🇫🇷 Collaborateur européen : UCBL Dr Joël Lachuer
🎓 PhD Student : Cyrine Abid

Grâce à cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au développement de solutions biotechnologiques durables et à la valorisation des ressources microbiennes et fongiques tunisiennes au service de l’innovation verte. 🌍♻️

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.3 est dédiée à l’exploration des microbiomes ex...
25/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.3 est dédiée à l’exploration des microbiomes extrêmes des lacs salés tunisiens afin d’identifier de nouveaux microorganismes producteurs de polyhydroxyalcanoates (PHA), des bioplastiques biodégradables à fort potentiel industriel. 🧪

Cette task s’appuie sur des approches métagénomiques et génomiques innovantes utilisant les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) pour valoriser les ressources microbiennes extrêmophiles et développer des alternatives durables aux plastiques conventionnels.

Les travaux portent notamment sur :

✅ L’exploration des microbiomes extrêmes des écosystèmes hypersalins tunisiens
✅ Le séquençage métagénomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’analyse bioinformatique avancée des métagénomes sur la plateforme UGEO
✅ Le séquençage complet de souches archéennes et bactériennes productrices de PHA
✅ L’identification des voies biosynthétiques impliquées dans la production des bioplastiques
✅ L’assemblage et l’annotation génomique des souches prometteuses
✅ L’optimisation de la production de PHA à partir de déchets industriels et de sources de carbone à faible coût
✅ La caractérisation physicochimique des PHAs (pureté, composition chimique, poids moléculaire et propriétés thermiques)
✅ L’étude des applications potentielles des bioplastiques dans les secteurs de l’emballage, du biomédical et de l’agriculture 🌾📦🩺

👨‍🔬 Task Lead : CBS Dr. Fatma Karray
👩‍🔬 Partenaire europeen : UGOE Dr. Heiko Liesegang
🎓 PhD student: Jihen GHAZEL

Grâce à cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au développement de solutions biotechnologiques innovantes et durables, favorisant la transition vers une bioéconomie circulaire et verte à partir de la biodiversité extrême tunisienne. 🌱🌎

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.2 est consacrée à l’exploration des biotopes ex...
25/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.2 est consacrée à l’exploration des biotopes extrêmes tunisiens afin de découvrir de nouvelles extremozymes à fort potentiel biotechnologique. 🧬

Cette task repose sur des approches métagénomiques et génomiques innovantes utilisant les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Les travaux portent notamment sur :
✅ L’exploration de biotopes extrêmes tunisiens
✅ Le séquençage métagénomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’analyse bioinformatique avancée des données NGS
✅ Le séquençage complet de souches fongiques extrêmophiles
✅ L’identification de gènes codant pour des enzymes d’intérêt industriel
✅ Le clonage, l’expression et la caractérisation d’extremozymes innovantes

Un intérêt particulier est accordé aux protéases et lipases, enzymes essentielles dans les secteurs des détergents, du textile et du cuir. 🧪

👨‍🔬 Task Lead : CBS Prof. Bassem Jaouadi
🇫🇷 Collaborateur européen : UCBL Prof. Joël Lachuer et Prof Abdelkarim Abousalham
👩‍🔬 Post-Doctorante : Dr Sondes Mechri

Grâce à cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au développement de solutions biotechnologiques durables et à la valorisation de la biodiversité extrême tunisienne au service de la bioéconomie verte. 🌱🌎

Dans le cadre du projet NGS-4-EcoProd, le Work Package 1 (WP1) est consacré au développement de produits éco-biotechnolo...
24/05/2026

Dans le cadre du projet NGS-4-EcoProd, le Work Package 1 (WP1) est consacré au développement de produits éco-biotechnologiques innovants à travers l’exploitation des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Le WP1 comprend 4 tasks principales :

🔹 Task 1.1 — Sporeless Biopesticides
🔹 Task 1.2 — Extremozymes
🔹 Task 1.3 — Bioplastics
🔹 Task 1.4 — Ergothioneine

Au cours des prochaines publications, nous mettrons en lumière chacune de ces tasks et leurs avancées scientifiques.
Nous commençons aujourd’hui par la Task 1.1 — Sporeless Biopesticides. 🌾♻️

Cette task vise à développer des biopesticides innovants, durables et respectueux de l’environnement grâce aux technologies NGS, contribuant ainsi à une agriculture plus verte et à des solutions de biocontrôle écologiques.

👩‍🔬 Task Leader : Dr Raida Zribi Zghal
👨‍🔬 Collaborateur CBS : Prof. Slim Tounsi
🇩🇪 Collaborateur européen : Université de Göttingen – Dr Heiko Liesegang
🎓 PhD Student : Ines Chouaibi

Les travaux portent notamment sur :

✅ L’identification de souches microbiennes à potentiel biopesticide
✅ Les analyses génomiques avancées via les technologies NGS
✅ Le développement de solutions de biocontrôle innovantes
✅ Le renforcement de la coopération scientifique internationale

Le WP1 représente un pilier essentiel du projet NGS-4-EcoProd, en favorisant l’innovation biotech durable au service de l’environnement et de la bioéconomie. 🌍

24/05/2026

Vidéo témoignage du PhD student jihen elghazel du projet ngs-4-ecoprod WP1 task 1.3 bioplastic sous la supervision du Dr Fatma karray et Dr Heiko Liesegang Allemagne université Gottingen et le WP2 leader

24/05/2026

Vidéo témoignage du Dr Heiko Liesegang le partenaire du projet ngs-4-ecoprod côté Allemagne université Gottingen et le WP2 leader

Petit retour en arrière… parce que certains souvenirs scientifiques méritent clairement un replay 😄Le 26 mars 2026 a eu ...
24/05/2026

Petit retour en arrière… parce que certains souvenirs scientifiques méritent clairement un replay 😄
Le 26 mars 2026 a eu lieu la cérémonie de clôture du projet NGS-4-ECOPROD : une journée riche en échanges, en science, en innovation… et probablement en litres de café consommés ☕🔬
Entre présentations, discussions passionnantes, moments de partage et belles collaborations, cet événement a marqué la fin d’une aventure scientifique aussi intense qu’enrichissante.
👏 Un grand merci à tous les partenaires, chercheurs, étudiants et participants ayant contribué au succès de ce projet et de cette cérémonie.
Parce qu’un projet se termine… mais que les idées, les collaborations et les souvenirs continuent ✨

🎉 Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Team! 🎉We are delighted to officially announce the publication of our latest...
24/05/2026

🎉 Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Team! 🎉

We are delighted to officially announce the publication of our latest research article in the International Journal of Molecular Sciences (IJMS) (Open Access, Q1, IF: 4.9), as part of the Special Issue:
“25th Anniversary of IJMS: Updates and Advances in Molecular Microbiology”

🧬 “Unraveling the Taxonomic Diversity and Functional Potential of the Tunisian Salterns, Abbassia and Thyna, via Integrated 16S-18S Amplicons and Shotgun Metagenomics”

👩‍🔬 Authors:
Sondes Mechri, Afef Najjari, Séverine Croze, Hadda-Imene Ouzari, Marilize Le Roes-Hill, Slim Tounsi, Joel Lachuer, and Bassem Jaouadi

🌍 Through integrated amplicon sequencing and shotgun metagenomics, this work explores the remarkable microbial diversity and functional potential of Tunisian hypersaline ecosystems, highlighting their importance as reservoirs of extremophiles with promising biotechnological applications.

📖 Article available online:
https://www.mdpi.com/1422-0067/27/11/4714

📄 PDF version:
https://www.mdpi.com/1422-0067/27/11/4714/pdf

This publication represents another important milestone following our recent genomics publication in International Journal of Biological Macromolecules, further reinforcing the power of combining genomics and metagenomics approaches to investigate extreme Tunisian environments and discover novel biomolecules and extremozymes.

💡 These achievements were realized within the framework of the Horizon Europe Twinning Project NGS-4-ECOPROD
(Grant Agreement ID: 101079425):
“From Next Generation Sequencing Microorganisms Towards Ecofriendly Biotech-Based Products”

🤝 Coordinated by Prof. Slim Tounsi (CBS, Tunisia), in collaboration with:
• Université Claude Bernard Lyon 1 (France)
• Georg-August-Universität Göttingen (Germany)

🙏 We sincerely thank all collaborators, partners, reviewers, and the IJMS editorial team for their valuable support throughout this work.

🚀 We remain committed to advancing sustainable biotechnology and molecular microbiology through cutting-edge omics sciences and international collaboration.

Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe
Centre de Biotechnologie de Sfax -مركز البيوتكنولوجيا بصفاقس -

Address

Centre De Biotechnologie De Sfax B. P 1177
Tunis
3018

Telephone

+21674871816

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