Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe

Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe Biotechnologie

Since the paper is now officially published, it is better to update the announcement from "accepted" to "published" and ...
15/06/2026

Since the paper is now officially published, it is better to update the announcement from "accepted" to "published" and include the final DOI and article link. For LinkedIn and Facebook, a slightly more concise and impact-oriented version generally performs better.
🎉📱 NEW PUBLICATION ALERT FROM THE NGS-4-ECOPROD CONSORTIUM! 📱🎉
We are proud to announce the publication of a new scientific article arising from WP1 – Task 1.2 (Extremozymes) of the Horizon Europe Twinning Project NGS-4-ECOPROD (Grant Agreement No. 101079425). 🚀🧬
📖 Published in the International Journal of Molecular Sciences (IJMS, Q1)
🔬 Title:
Hybrid Whole-Genome Sequencing of Penicillium crustosum CTM10622 Uncovers a Highly Thermostable Alkaline Serine Lipase with Biotechnological Relevance
📄 DOI:
https://doi.org/10.3390/ijms27125389
🌐 Full Article:
https://www.mdpi.com/1422-0067/27/12/5389
đŸ‘©â€đŸ”ŹđŸ‘šâ€đŸ”Ź Authors:
Sondes Mechri, Afef Najjari, SĂ©verine Croze, Fakher Frikha, Nadia Zarai, Hadda-Imene Ouzari, Alexandre Noiriel, Ebru Toksoy Öner, Abdelkarim Abousalham, Marilize Le Roes-Hill, Slim Tounsi, Joel Lachuer*, and Bassem Jaouadi*
🌟 Published in the Macromolecules Section of IJMS.
This study highlights the power of hybrid whole-genome sequencing combining Illumina and Oxford Nanopore technologies to explore extremophilic fungi isolated from Tunisian extreme environments. Through comprehensive genomic analysis, we identified and characterized a novel highly thermostable alkaline serine lipase exhibiting remarkable potential for industrial biotechnology applications, including green biocatalysis, biodiesel production, waste valorization, and detergent formulations.
🌍 This publication represents another major scientific milestone for the NGS-4-ECOPROD consortium and complements our previous achievements:
✅ Whole-genome sequencing-guided discovery of a novel thermostable protease from Streptomyces cyaneofuscatus
(International Journal of Biological Macromolecules)
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2025.146696
✅ Integrated metagenomic and metataxonomic exploration of Tunisian hypersaline ecosystems
(International Journal of Molecular Sciences)
https://www.mdpi.com/1422-0067/27/11/4714
Together, these studies demonstrate how genomics, metagenomics, and functional biotechnology can accelerate the discovery of novel extremozymes and eco-friendly biomolecules from underexplored extreme ecosystems.
💡 Acknowledgment
This work was carried out within the framework of the European Union’s Horizon Europe Research and Innovation Programme under HORIZON-WIDERA-2021-ACCESS-03-01 through the Twinning Project NGS-4-ECOPROD:
“FROM NEXT GENERATION SEQUENCING MICROORGANISMS TOWARDS ECOFRIENDLY BIOTECH BASED PRODUCTS”
đŸ€ The project is coordinated by Prof. Slim Tounsi at the Centre of Biotechnology of Sfax (CBS, Tunisia), in partnership with UniversitĂ© Claude Bernard Lyon 1 (France) and Georg-August University of Göttingen (Germany), with strong scientific collaborations extending to South Africa and TĂŒrkiye.
🙏 We sincerely thank all researchers, students, collaborators, reviewers, and partner institutions whose dedication and teamwork made this achievement possible.
🚀 Advancing sustainable biotechnology through genomics, extremozymes, and international scientific excellence.
Centre de Biotechnologie de Sfax - Ù…Ű±ÙƒŰČ Ű§Ù„ŰšÙŠÙˆŰȘÙƒÙ†ÙˆÙ„ÙˆŰŹÙŠŰ§ ŰšŰ”ÙŰ§Ù‚Űł

26/05/2026

Le 26 mars 2026, Ă  l’HĂŽtel El Mouradi Gammarth Ă  Tunis, nous avons cĂ©lĂ©brĂ© ensemble la clĂŽture du projet NGS-4-EcoProd, une initiative porteuse d’innovation, de collaboration et d’engagement pour une production plus durable et responsable.

Cette cĂ©rĂ©monie a Ă©tĂ© l’occasion de revenir sur les rĂ©alisations du projet, de partager les expĂ©riences des diffĂ©rents partenaires et de mettre en lumiĂšre les impacts positifs gĂ©nĂ©rĂ©s tout au long de cette aventure.

🙏 Un grand merci Ă  tous les partenaires, experts, participants et invitĂ©s qui ont contribuĂ© au succĂšs de ce projet et Ă  la rĂ©ussite de cet Ă©vĂ©nement.

đŸ“œïž DĂ©couvrez dans cette vidĂ©o rĂ©capitulative les moments forts de cette journĂ©e riche en Ă©changes, en inspiration et en perspectives d’avenir.

Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Consortium! 🎉We are delighted to announce the acceptance of our third scientif...
26/05/2026

Proud Announcement from the NGS-4-ECOPROD Consortium! 🎉
We are delighted to announce the acceptance of our third scientific publication related to WP1 – Task 1.2: Extremozymes within the Horizon Europe Twinning Project NGS-4-ECOPROD (Grant Agreement No. 101079425)! 🚀🧬
📄 Accepted in the International Journal of Molecular Sciences (IJMS, Q1, IF: 4.9):
📝 Title:
Hybrid Whole-Genome Sequencing of Penicillium crustosum CTM10622 Uncovers a Highly Thermostable Alkaline Serine Lipase with Biotechnological Relevance
đŸ‘©â€đŸ”ŹđŸ‘šâ€đŸ”Ź Authors:
Sondes Mechri, Afef Najjari, SĂ©verine Croze, Fakher Frikha, Nadia Zarai, Hadda-Imene Ouzari, Alexandre Noiriel, Ebru Toksoy Öner, Abdelkarim Abousalham, Marilize Le Roes-Hill, Slim Tounsi, Joel Lachuer*, and Bassem Jaouadi*
🌟 This article belongs to the Section: Macromolecules of IJMS.
This study demonstrates the power of hybrid whole-genome sequencing combining Illumina and Oxford Nanopore technologies for the exploration of extremophilic fungi isolated from Tunisian extreme environments. The work enabled the identification and characterization of a novel highly thermostable alkaline serine lipase with strong potential for industrial biotechnology, green biocatalysis, biodiesel production, and detergent applications.
🌍 This publication represents another important milestone for the NGS-4-ECOPROD consortium following our previous publications on:
✅ Whole-genome sequencing of Streptomyces cyaneofuscatus for protease discovery (International Journal of Biological Macromolecules, Q1, IF: 8.5)
🔗 https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2025.146696
✅ Integrated metagenomics and metataxonomics of Tunisian hypersaline ecosystems (International Journal of Molecular Sciences, Q1, IF: 4.9)
🌟 This article belongs to the Special Issue:
“25th Anniversary of IJMS: Updates and Advances in Molecular Microbiology”
🔗 https://www.mdpi.com/1422-0067/27/11/4714
Together, these studies reinforce the importance of combining genomics, metagenomics, and functional biotechnology approaches to discover novel extremozymes and ecofriendly biomolecules from extreme Tunisian ecosystems.
💡 Funding & Project Acknowledgment:
This work was conducted within the European Union’s Horizon Europe Research and Innovation Program under the HORIZON-Coordination and Support Action (CSA), HORIZON-WIDERA-2021-ACCESS-03-01, through the Twinning Project NGS-4-ECOPROD entitled:
“FROM NEXT GENERATION SEQUENCING MICROORGANISMS TOWARDS ECOFRIENDLY BIOTECH BASED PRODUCTS”.
đŸ€ The project is coordinated by Prof. Slim Tounsi at the Centre of Biotechnology of Sfax (CBS, Tunisia), in collaboration with UniversitĂ© Claude Bernard Lyon 1 (France) and Georg-August-UniversitĂ€t Göttingen (Germany).
🙏 We sincerely thank all collaborators, students, researchers, reviewers, and partner institutions for their valuable contributions, scientific support, and excellent teamwork throughout this achievement.
🚀 We remain committed to advancing sustainable biotechnology, extremozymes research, and cutting-edge omics sciences through international collaboration and innovation.
Ngs-4-Ecoprod twinning Horizon Europe
Centre de Biotechnologie de Sfax -Ù…Ű±ÙƒŰČ Ű§Ù„ŰšÙŠÙˆŰȘÙƒÙ†ÙˆÙ„ÙˆŰŹÙŠŰ§ ŰšŰ”ÙŰ§Ù‚Űł - -

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.4 est consacrĂ©e Ă  l’étude et Ă  l’optimisation d...
26/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.4 est consacrĂ©e Ă  l’étude et Ă  l’optimisation de la biosynthĂšse de l’ergothionĂ©ine, un puissant antioxydant naturel, Ă  partir de souches fongiques indigĂšnes. 🍄🧬
Cette task repose sur des approches génomiques innovantes utilisant les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Les travaux portent notamment sur :
✅ L’identification de souches fongiques surproductrices d’ergothionĂ©ine
✅ Le sĂ©quençage gĂ©nomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’assemblage et l’annotation avancĂ©e des gĂ©nomes fongiques
✅ L’identification des voies de biosynthĂšse de l’ergothionĂ©ine
✅ Le clonage et l’expression des gĂšnes d’intĂ©rĂȘt dans Saccharomyces cerevisiae
✅ L’optimisation des conditions de culture et des procĂ©dĂ©s de production et de purification de l’ergothionĂ©ine

Cette task vise Ă  dĂ©velopper des stratĂ©gies biotechnologiques innovantes pour une production durable et efficace de molĂ©cules naturelles Ă  haute valeur ajoutĂ©e pour les secteurs de la santĂ©, de la nutrition et de la bioĂ©conomie verte. đŸŒ±

đŸ‘©â€đŸ”Ź Task Leads : CBS Dr Najla Kharrat
đŸ‡«đŸ‡· Collaborateur europĂ©en : UCBL Dr JoĂ«l Lachuer
🎓 PhD Student : Cyrine Abid

GrĂące Ă  cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au dĂ©veloppement de solutions biotechnologiques durables et Ă  la valorisation des ressources microbiennes et fongiques tunisiennes au service de l’innovation verte. đŸŒâ™»ïž

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.3 est dĂ©diĂ©e Ă  l’exploration des microbiomes ex...
25/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.3 est dĂ©diĂ©e Ă  l’exploration des microbiomes extrĂȘmes des lacs salĂ©s tunisiens afin d’identifier de nouveaux microorganismes producteurs de polyhydroxyalcanoates (PHA), des bioplastiques biodĂ©gradables Ă  fort potentiel industriel. đŸ§Ș

Cette task s’appuie sur des approches mĂ©tagĂ©nomiques et gĂ©nomiques innovantes utilisant les technologies de sĂ©quençage de nouvelle gĂ©nĂ©ration (NGS) pour valoriser les ressources microbiennes extrĂȘmophiles et dĂ©velopper des alternatives durables aux plastiques conventionnels.

Les travaux portent notamment sur :

✅ L’exploration des microbiomes extrĂȘmes des Ă©cosystĂšmes hypersalins tunisiens
✅ Le sĂ©quençage mĂ©tagĂ©nomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’analyse bioinformatique avancĂ©e des mĂ©tagĂ©nomes sur la plateforme UGEO
✅ Le sĂ©quençage complet de souches archĂ©ennes et bactĂ©riennes productrices de PHA
✅ L’identification des voies biosynthĂ©tiques impliquĂ©es dans la production des bioplastiques
✅ L’assemblage et l’annotation gĂ©nomique des souches prometteuses
✅ L’optimisation de la production de PHA Ă  partir de dĂ©chets industriels et de sources de carbone Ă  faible coĂ»t
✅ La caractĂ©risation physicochimique des PHAs (puretĂ©, composition chimique, poids molĂ©culaire et propriĂ©tĂ©s thermiques)
✅ L’étude des applications potentielles des bioplastiques dans les secteurs de l’emballage, du biomĂ©dical et de l’agriculture đŸŒŸđŸ“ŠđŸ©ș

👹‍🔬 Task Lead : CBS Dr. Fatma Karray
đŸ‘©â€đŸ”Ź Partenaire europeen : UGOE Dr. Heiko Liesegang
🎓 PhD student: Jihen GHAZEL

GrĂące Ă  cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au dĂ©veloppement de solutions biotechnologiques innovantes et durables, favorisant la transition vers une bioĂ©conomie circulaire et verte Ă  partir de la biodiversitĂ© extrĂȘme tunisienne. đŸŒ±đŸŒŽ

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.2 est consacrĂ©e Ă  l’exploration des biotopes ex...
25/05/2026

Dans le cadre du Work Package 1 (WP1) du projet NGS-4-EcoProd, la Task 1.2 est consacrĂ©e Ă  l’exploration des biotopes extrĂȘmes tunisiens afin de dĂ©couvrir de nouvelles extremozymes Ă  fort potentiel biotechnologique. 🧬

Cette task repose sur des approches métagénomiques et génomiques innovantes utilisant les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS).

Les travaux portent notamment sur :
✅ L’exploration de biotopes extrĂȘmes tunisiens
✅ Le sĂ©quençage mĂ©tagĂ©nomique via les technologies Illumina et Nanopore
✅ L’analyse bioinformatique avancĂ©e des donnĂ©es NGS
✅ Le sĂ©quençage complet de souches fongiques extrĂȘmophiles
✅ L’identification de gĂšnes codant pour des enzymes d’intĂ©rĂȘt industriel
✅ Le clonage, l’expression et la caractĂ©risation d’extremozymes innovantes

Un intĂ©rĂȘt particulier est accordĂ© aux protĂ©ases et lipases, enzymes essentielles dans les secteurs des dĂ©tergents, du textile et du cuir. đŸ§Ș

👹‍🔬 Task Lead : CBS Prof. Bassem Jaouadi
đŸ‡«đŸ‡· Collaborateur europĂ©en : UCBL Prof. JoĂ«l Lachuer et Prof Abdelkarim Abousalham
đŸ‘©â€đŸ”Ź Post-Doctorante : Dr Sondes Mechri

GrĂące Ă  cette task, le projet NGS-4-EcoProd contribue au dĂ©veloppement de solutions biotechnologiques durables et Ă  la valorisation de la biodiversitĂ© extrĂȘme tunisienne au service de la bioĂ©conomie verte. đŸŒ±đŸŒŽ

Dans le cadre du projet NGS-4-EcoProd, le Work Package 1 (WP1) est consacré au développement de produits éco-biotechnolo...
24/05/2026

Dans le cadre du projet NGS-4-EcoProd, le Work Package 1 (WP1) est consacrĂ© au dĂ©veloppement de produits Ă©co-biotechnologiques innovants Ă  travers l’exploitation des technologies de sĂ©quençage de nouvelle gĂ©nĂ©ration (NGS).

Le WP1 comprend 4 tasks principales :

đŸ”č Task 1.1 — Sporeless Biopesticides
đŸ”č Task 1.2 — Extremozymes
đŸ”č Task 1.3 — Bioplastics
đŸ”č Task 1.4 — Ergothioneine

Au cours des prochaines publications, nous mettrons en lumiÚre chacune de ces tasks et leurs avancées scientifiques.
Nous commençons aujourd’hui par la Task 1.1 — Sporeless Biopesticides. đŸŒŸâ™»ïž

Cette task vise Ă  dĂ©velopper des biopesticides innovants, durables et respectueux de l’environnement grĂące aux technologies NGS, contribuant ainsi Ă  une agriculture plus verte et Ă  des solutions de biocontrĂŽle Ă©cologiques.

đŸ‘©â€đŸ”Ź Task Leader : Dr Raida Zribi Zghal
👹‍🔬 Collaborateur CBS : Prof. Slim Tounsi
đŸ‡©đŸ‡Ș Collaborateur europĂ©en : UniversitĂ© de Göttingen – Dr Heiko Liesegang
🎓 PhD Student : Ines Chouaibi

Les travaux portent notamment sur :

✅ L’identification de souches microbiennes à potentiel biopesticide
✅ Les analyses gĂ©nomiques avancĂ©es via les technologies NGS
✅ Le dĂ©veloppement de solutions de biocontrĂŽle innovantes
✅ Le renforcement de la coopĂ©ration scientifique internationale

Le WP1 reprĂ©sente un pilier essentiel du projet NGS-4-EcoProd, en favorisant l’innovation biotech durable au service de l’environnement et de la bioĂ©conomie. 🌍

24/05/2026

Vidéo témoignage du PhD student jihen elghazel du projet ngs-4-ecoprod WP1 task 1.3 bioplastic sous la supervision du Dr Fatma karray et Dr Heiko Liesegang Allemagne université Gottingen et le WP2 leader

24/05/2026

Vidéo témoignage du Dr Heiko Liesegang le partenaire du projet ngs-4-ecoprod cÎté Allemagne université Gottingen et le WP2 leader

Petit retour en arriĂšre
 parce que certains souvenirs scientifiques mĂ©ritent clairement un replay 😄Le 26 mars 2026 a eu ...
24/05/2026

Petit retour en arriĂšre
 parce que certains souvenirs scientifiques mĂ©ritent clairement un replay 😄
Le 26 mars 2026 a eu lieu la cĂ©rĂ©monie de clĂŽture du projet NGS-4-ECOPROD : une journĂ©e riche en Ă©changes, en science, en innovation
 et probablement en litres de cafĂ© consommĂ©s ☕🔬
Entre prĂ©sentations, discussions passionnantes, moments de partage et belles collaborations, cet Ă©vĂ©nement a marquĂ© la fin d’une aventure scientifique aussi intense qu’enrichissante.
👏 Un grand merci Ă  tous les partenaires, chercheurs, Ă©tudiants et participants ayant contribuĂ© au succĂšs de ce projet et de cette cĂ©rĂ©monie.
Parce qu’un projet se termine
 mais que les idĂ©es, les collaborations et les souvenirs continuent ✹

Address

Centre De Biotechnologie De Sfax B. P 1177
Tunis
3018

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